54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2105 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 270 aa  514  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  39.41 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  47.39 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  48.42 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  44.27 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  45.03 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  40.85 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  39.9 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  43.43 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  46.7 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  42.13 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4267  UbiA prenyltransferase  35.48 
 
 		 310 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  37.21 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  31.9 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  30.81 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.81 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.12 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.47 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  30.11 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.65 
 
 		 333 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.61 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.94 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1161  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  30.41 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  26.29 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  30.1 
 
 		 277 aa  49.3  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  30.59 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.21 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.89 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  31.12 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0527  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.52 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0079711 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.34 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  32.21 
 
 		 284 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  32.14 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  25.74 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.74 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.74 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.74 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.74 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.74 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.74 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.6 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  25.74 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.11 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.55 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  27.22 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.64 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  36.07 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0067  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.27 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.209668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1967  1,4-dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  28.83 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4142  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.07 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.55 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.43 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2658  UbiA prenyltransferase  26.09 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.02 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>