178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2094 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  100 
 
 
246 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  73.77 
 
 
244 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  67.48 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.09 
 
 
246 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  47.77 
 
 
251 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  48.16 
 
 
244 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  45.71 
 
 
267 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  48.37 
 
 
250 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  48.39 
 
 
250 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.56 
 
 
258 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.16 
 
 
258 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  47.97 
 
 
252 aa  201  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  45.34 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.94 
 
 
251 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  43.37 
 
 
273 aa  194  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  46.75 
 
 
252 aa  194  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  44.94 
 
 
254 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  46.53 
 
 
250 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  46.53 
 
 
250 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  47.37 
 
 
251 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  44.94 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.71 
 
 
254 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  44.76 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  45.12 
 
 
251 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  44.13 
 
 
251 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  42.74 
 
 
251 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  41.46 
 
 
250 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  43.32 
 
 
250 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  43.09 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  43.09 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  42.34 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  48.13 
 
 
243 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  42.28 
 
 
251 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  44.72 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.24 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  46.33 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  41.87 
 
 
250 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  44.31 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  44.31 
 
 
252 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  44.31 
 
 
252 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  43.32 
 
 
247 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  42.68 
 
 
247 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  41.87 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  42.11 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  48.17 
 
 
402 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  48.28 
 
 
249 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  39.68 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  41.06 
 
 
253 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  41.22 
 
 
249 aa  161  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  41.55 
 
 
246 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  43.64 
 
 
255 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.35 
 
 
249 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  41.06 
 
 
248 aa  158  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  40.24 
 
 
264 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.03 
 
 
251 aa  141  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  51.85 
 
 
137 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.89 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.77 
 
 
248 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.07 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  36.44 
 
 
261 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  39.18 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.48 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.32 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  38.49 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  32.81 
 
 
255 aa  98.6  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  32.95 
 
 
256 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.64 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2013  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like  69.23 
 
 
167 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  30.62 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  30.83 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.14 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  32.74 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  32.17 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  40.16 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  31.78 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.15 
 
 
320 aa  62.4  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
291 aa  62.4  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  33.33 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.24 
 
 
320 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
298 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
295 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.56 
 
 
327 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
482 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
309 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  31.44 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  27.03 
 
 
323 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
319 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
318 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  27.03 
 
 
323 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>