More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2070 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 163 aa  329  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  32.5 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.5 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.5 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.5 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.5 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  32.5 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.5 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.5 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.81 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.81 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.81 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.81 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.81 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.91 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  34.85 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  35 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  43.56 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 233 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  35.29 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  24.47 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>