199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2037 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 154 aa  299  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  59.22 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  66.22 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  57.83 
 
 		 104 aa  87  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  59.76 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  60.81 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  54.21 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  43.36 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  54.93 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  60.38 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.22 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  46.38 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  47.22 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  54.39 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  47.22 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  45.83 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  48.44 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  38.75 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  45.07 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  45.07 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  42.68 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  41.1 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  45.76 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  50.88 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 260 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  45.21 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 325 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  39.6 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  43.48 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 252 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 277 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  48.15 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 197 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 504 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  36.28 
 
 		 256 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 105 aa  47.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 201 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 259 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 201 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 259 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>