More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2003 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2003  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
288 aa  573  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0706427  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  64.98 
 
 
285 aa  349  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5672  alpha/beta hydrolase fold protein  53.9 
 
 
289 aa  261  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2923  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  42.7 
 
 
287 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  46.21 
 
 
280 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5694  alpha/beta hydrolase fold protein  42.65 
 
 
285 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5394  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 
274 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.117784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5305  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 
274 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5684  alpha/beta hydrolase fold  45 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5859  alpha/beta hydrolase fold  43.93 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  40.71 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3236  alpha/beta hydrolase fold  41.43 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21765  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
281 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5258  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
281 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5169  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
281 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0857  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.21 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00184237  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  32.12 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4132  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
280 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28.98 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  23.46 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 
253 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.5 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  24.56 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  23.26 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  22.06 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  29.15 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  22.78 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  22.92 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  21.88 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  21.88 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  21.88 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  21.88 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.3 
 
 
425 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  22.81 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  21.88 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
300 aa  62.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 
267 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.6 
 
 
276 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  22.97 
 
 
257 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
350 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  21.9 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.47 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
261 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
285 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  22.53 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  22.89 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.15 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
271 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
315 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 
336 aa  59.3  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  21.93 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  25.96 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  23.08 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>