More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1909 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
408 aa  782    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  66.94 
 
 
425 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  34.92 
 
 
394 aa  256  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.78 
 
 
403 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  40.2 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  37.4 
 
 
399 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  37.4 
 
 
399 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  40.1 
 
 
399 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  41.44 
 
 
395 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.98 
 
 
383 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 
399 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  39.39 
 
 
405 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  39.39 
 
 
405 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  38.18 
 
 
385 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  42.31 
 
 
400 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  37.06 
 
 
399 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  37.66 
 
 
399 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  40.11 
 
 
404 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  38.4 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  38.4 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  38.4 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  40.64 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  40.1 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  36.67 
 
 
394 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  38.83 
 
 
405 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  39.84 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  39.84 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
406 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
397 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  40.78 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  40 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  40 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  40 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  40.27 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.31 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  40 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  40 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  40 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  42.74 
 
 
402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 
406 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  35.09 
 
 
394 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  40.26 
 
 
399 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  35.34 
 
 
394 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  35.09 
 
 
394 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  35.09 
 
 
394 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
391 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  35.09 
 
 
394 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  35.09 
 
 
394 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  41.02 
 
 
415 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 
402 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 
402 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  34.94 
 
 
415 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  36.6 
 
 
407 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 
389 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
413 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  40.4 
 
 
405 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  40.44 
 
 
389 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 
394 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 
399 aa  205  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  34.26 
 
 
399 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  38.93 
 
 
404 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  34.26 
 
 
399 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  38.64 
 
 
391 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  34.26 
 
 
399 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  36.2 
 
 
402 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
387 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  41.24 
 
 
403 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
389 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
394 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  34.21 
 
 
407 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.44 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  38.83 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  36.18 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  34.58 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  36.18 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  36.18 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  36.18 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 
399 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  36.63 
 
 
394 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  38.92 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  34.26 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  34.26 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  38.34 
 
 
401 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  36.29 
 
 
398 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  40.27 
 
 
403 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  37.47 
 
 
399 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  34.88 
 
 
395 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  37.75 
 
 
395 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  37.2 
 
 
400 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  39.62 
 
 
398 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 
388 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  37.3 
 
 
400 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  39.34 
 
 
400 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  39.85 
 
 
395 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
410 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  34.26 
 
 
410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>