More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1896 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  100 
 
 		 391 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.4 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  39.92 
 
 		 407 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  42.78 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  33.33 
 
 		 386 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  37.35 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.79 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.12 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  35.68 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 418 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  35.4 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  34.4 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  36.36 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.72 
 
 		 744 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 310 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  36.02 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  40.65 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  32.14 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.25 
 
 		 370 aa  86.7  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  31.47 
 
 		 359 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.86 
 
 		 786 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  33.04 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.37 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.12 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  30.29 
 
 		 611 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.54 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  30.1 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.37 
 
 		 699 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  27.81 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  27.57 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  29.73 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  32.28 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  32.2 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  28.28 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  27.59 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16240  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.429357  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  28.89 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  23.96 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.65 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  34.16 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.77 
 
 		 726 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  32.57 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.91 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.76 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.020485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  32.17 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.08 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  29.95 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  26.32 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  31.25 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  28.91 
 
 		 572 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 351 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  29.47 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0638  histidine kinase  30.08 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.509372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  31.09 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  24.48 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  24.18 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  24.18 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  24.48 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  24.48 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>