More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1880 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
370 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  55.53 
 
 
366 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  54.52 
 
 
385 aa  328  9e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  51.58 
 
 
368 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  51.95 
 
 
373 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  51.96 
 
 
373 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  51.18 
 
 
385 aa  311  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  51.71 
 
 
386 aa  309  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  47.87 
 
 
425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  52.51 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  51.56 
 
 
386 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  51.56 
 
 
386 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  51.56 
 
 
386 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  50.13 
 
 
374 aa  299  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  50.94 
 
 
381 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  49.36 
 
 
397 aa  295  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  49.09 
 
 
390 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  51.58 
 
 
368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  42.45 
 
 
367 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  48.26 
 
 
398 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  50 
 
 
385 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  47.75 
 
 
369 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  52.01 
 
 
363 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  49.87 
 
 
389 aa  268  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  47.27 
 
 
372 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  49.08 
 
 
380 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  44.95 
 
 
357 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  42.38 
 
 
433 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  44.5 
 
 
402 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  42.54 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  43.65 
 
 
375 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  47.54 
 
 
483 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  40.58 
 
 
389 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  40.62 
 
 
421 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  51.33 
 
 
266 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  43.01 
 
 
360 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  40.8 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  41.18 
 
 
316 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  38.59 
 
 
388 aa  195  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  38.55 
 
 
323 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  38.56 
 
 
376 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  39.83 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  38.98 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  37.74 
 
 
342 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  39.04 
 
 
323 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  39.83 
 
 
338 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  37.08 
 
 
340 aa  170  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  36.08 
 
 
318 aa  169  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.26 
 
 
345 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  33.42 
 
 
372 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  36.57 
 
 
356 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  35.91 
 
 
325 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  36.83 
 
 
453 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.36 
 
 
340 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  33.71 
 
 
340 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  49.12 
 
 
225 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  47.24 
 
 
240 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  35.71 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.49 
 
 
372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  36.39 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  35.77 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41.18 
 
 
248 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.02 
 
 
244 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  32.96 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.67 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.77 
 
 
341 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  33.71 
 
 
337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.66 
 
 
250 aa  146  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  35.77 
 
 
343 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  35.77 
 
 
343 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  35.49 
 
 
339 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.53 
 
 
228 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  35.59 
 
 
331 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  34.33 
 
 
342 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  34.63 
 
 
340 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  34.89 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  30.73 
 
 
398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  35.16 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  35.16 
 
 
341 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  35.16 
 
 
341 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  33.52 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  33.52 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  35.91 
 
 
315 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  30.91 
 
 
376 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  31.07 
 
 
319 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  32.88 
 
 
365 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.91 
 
 
233 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  46.25 
 
 
176 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  33.42 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  34.05 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  32.32 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  34.05 
 
 
341 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  34.25 
 
 
339 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  35.16 
 
 
370 aa  135  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  34.07 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  34.45 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  44.51 
 
 
233 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  30.52 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  46.54 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.03 
 
 
353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>