288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1807 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 
789 aa  1528    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  45.74 
 
 
495 aa  343  9e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  45.18 
 
 
503 aa  340  5.9999999999999996e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  45.5 
 
 
495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0661  pyridoxal-dependent decarboxylase  48.66 
 
 
484 aa  337  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000151703  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  45.28 
 
 
490 aa  327  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  44.61 
 
 
488 aa  325  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.31 
 
 
522 aa  320  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  42.27 
 
 
511 aa  318  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.22 
 
 
494 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0214  Pyridoxal-dependent decarboxylase  40.51 
 
 
527 aa  312  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  38.54 
 
 
484 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  45.02 
 
 
488 aa  308  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  39.96 
 
 
502 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  39.29 
 
 
961 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.83 
 
 
967 aa  289  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4055  pyridoxal-dependent decarboxylase  44.83 
 
 
554 aa  286  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.505018  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.43 
 
 
505 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  40.14 
 
 
958 aa  281  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  40.28 
 
 
963 aa  281  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  36.13 
 
 
507 aa  280  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  41.1 
 
 
530 aa  279  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.26 
 
 
515 aa  276  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  38.26 
 
 
515 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  38.01 
 
 
515 aa  274  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.77 
 
 
529 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  36.96 
 
 
515 aa  269  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  39.47 
 
 
511 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  39.08 
 
 
551 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  40.79 
 
 
508 aa  250  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0512  Pyridoxal-dependent decarboxylase  37.58 
 
 
544 aa  239  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  39.75 
 
 
530 aa  235  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1803  Pyridoxal-dependent decarboxylase  43.5 
 
 
529 aa  230  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0338537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  40.57 
 
 
484 aa  229  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  37.62 
 
 
490 aa  226  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.21 
 
 
534 aa  220  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.2 
 
 
552 aa  191  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.79 
 
 
552 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.15 
 
 
517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  30.55 
 
 
548 aa  183  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  30.54 
 
 
548 aa  183  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.33 
 
 
475 aa  175  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.22 
 
 
550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.29 
 
 
484 aa  173  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.3 
 
 
529 aa  172  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.01 
 
 
484 aa  171  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.01 
 
 
484 aa  171  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.01 
 
 
484 aa  171  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  29.09 
 
 
543 aa  170  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.96 
 
 
466 aa  170  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.41 
 
 
560 aa  170  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  31.2 
 
 
548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.44 
 
 
547 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.48 
 
 
567 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.71 
 
 
479 aa  167  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  30.46 
 
 
552 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  29.6 
 
 
462 aa  167  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.36 
 
 
573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.54 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.67 
 
 
546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  33.5 
 
 
489 aa  164  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.53 
 
 
541 aa  163  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.98 
 
 
550 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  35.19 
 
 
483 aa  161  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  36.04 
 
 
492 aa  160  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.29 
 
 
611 aa  160  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.55 
 
 
549 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.77 
 
 
461 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.38 
 
 
549 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.38 
 
 
549 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.34 
 
 
548 aa  157  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.26 
 
 
538 aa  157  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.38 
 
 
549 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.88 
 
 
549 aa  157  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.98 
 
 
554 aa  157  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6749  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.92 
 
 
574 aa  157  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  27.38 
 
 
533 aa  157  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.55 
 
 
549 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.84 
 
 
549 aa  157  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.88 
 
 
480 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.38 
 
 
549 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.73 
 
 
461 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.53 
 
 
461 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  27.72 
 
 
456 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  32.13 
 
 
456 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.88 
 
 
489 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.23 
 
 
546 aa  151  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  32.85 
 
 
483 aa  151  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.57 
 
 
510 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  31.33 
 
 
470 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1440  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.73 
 
 
474 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2266  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.74 
 
 
517 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3931  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.55 
 
 
536 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  30.39 
 
 
491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.1 
 
 
496 aa  142  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.2 
 
 
477 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.13 
 
 
492 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.69 
 
 
486 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  32 
 
 
502 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.4 
 
 
458 aa  140  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>