29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1771 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2879  hypothetical protein  72.48 
 
 
166 aa  221  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494384  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1028  hypothetical protein  68.42 
 
 
96 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576295  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  35.17 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  34.48 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  34.48 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  36.22 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  33.8 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  32.64 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  27.15 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  31.85 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  28.67 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  32.58 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  28.47 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  30.26 
 
 
172 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  31.82 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  31.82 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  30.09 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02034  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  29.66 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  29.05 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  27.52 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  34.91 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  25.47 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  24.82 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2917  hypothetical protein  28.37 
 
 
150 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  36.67 
 
 
185 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  26.95 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  26.24 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>