117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1675 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  618  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  58.48 
 
 
328 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  50.88 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  49.11 
 
 
322 aa  271  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  45.12 
 
 
681 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  41.31 
 
 
661 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  43.57 
 
 
678 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  41.58 
 
 
687 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  42.81 
 
 
665 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  42.81 
 
 
665 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  42.81 
 
 
665 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  40.2 
 
 
718 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  40.4 
 
 
718 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  39.27 
 
 
651 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  41.16 
 
 
679 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.78 
 
 
731 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  40.79 
 
 
651 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  43.45 
 
 
736 aa  205  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  43.27 
 
 
664 aa  205  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  39.04 
 
 
691 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  38.33 
 
 
752 aa  202  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  41.88 
 
 
719 aa  201  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  37.46 
 
 
692 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  39.08 
 
 
672 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  40.4 
 
 
722 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  40.94 
 
 
686 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.66 
 
 
675 aa  195  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  41.76 
 
 
676 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  37.79 
 
 
697 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  34.73 
 
 
739 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  42.59 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  37.73 
 
 
711 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  40.33 
 
 
708 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.67 
 
 
319 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  39.29 
 
 
632 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  39.86 
 
 
671 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  34.63 
 
 
708 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.43 
 
 
683 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  36.39 
 
 
631 aa  169  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.11 
 
 
654 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  34.84 
 
 
687 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  33.68 
 
 
387 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  31.16 
 
 
671 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  29.17 
 
 
394 aa  126  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  36.57 
 
 
354 aa  123  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.39 
 
 
613 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  31.19 
 
 
327 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  31.49 
 
 
646 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  30.69 
 
 
642 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  28.94 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  29.04 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  29.04 
 
 
331 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  28.94 
 
 
331 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  30.43 
 
 
641 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  30.43 
 
 
641 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  29.04 
 
 
308 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  30.36 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  30.34 
 
 
637 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.82 
 
 
307 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.89 
 
 
326 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  28.29 
 
 
277 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  32.78 
 
 
254 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  28.29 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  27.49 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  27.49 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  26.69 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  26.69 
 
 
274 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  30.45 
 
 
273 aa  92.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  30.77 
 
 
651 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  28.73 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  28.42 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.09 
 
 
246 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  27.15 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.99 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  30.47 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  27.88 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  27.33 
 
 
653 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.2 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  26.26 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  27.21 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  29.89 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  27.94 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  29.89 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  29.89 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  29.89 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  29.89 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  29.89 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  29.89 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.94 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  31.12 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  26.44 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  28.47 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  38.36 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  27.39 
 
 
316 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  30.08 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3086  hypothetical protein  38.75 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  hitchhiker  0.00886483 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  27.92 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  25.79 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  27.78 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  28.8 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>