42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1392 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  100 
 
 
272 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  40.41 
 
 
246 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  37.75 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  37.75 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  37.01 
 
 
261 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  37.75 
 
 
249 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  36.84 
 
 
262 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  37.23 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  32.9 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  32.48 
 
 
255 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  34.93 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  33.9 
 
 
255 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  37.04 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  33.2 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  39.39 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  30.21 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  28.27 
 
 
249 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  33.18 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  30.93 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  30.58 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  32.05 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  32.88 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  31.43 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  29.37 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  29.92 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  32.32 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  31.94 
 
 
254 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  28.44 
 
 
257 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  28.89 
 
 
250 aa  62.4  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  28.26 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  26.61 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  28.29 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  26.25 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  30.99 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  32.32 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  29.33 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  26.36 
 
 
247 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0474  protein of unknown function DUF1503  28.71 
 
 
234 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4225  hypothetical protein  25.43 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  24.63 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6379  hypothetical protein  33.71 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  36.21 
 
 
187 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>