28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1347 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1347  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  51.16 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  45.53 
 
 		 253 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  45.91 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  47.21 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  44.31 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1263  hypothetical protein  41.57 
 
 		 295 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  45.88 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  39.68 
 
 		 170 aa  62  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  35.96 
 
 		 162 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  39.08 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  45.9 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  38.64 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  34.94 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  30.58 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  27.87 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  38.71 
 
 		 152 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  31.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  50 
 
 		 159 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  35.63 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  34.25 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2492  hypothetical protein  30.49 
 
 		 159 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  32.06 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  27.66 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  38.37 
 
 		 153 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  26.55 
 
 		 187 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  30.65 
 
 		 160 aa  42.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>