233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1320 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  100 
 
 		 422 aa  845    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  25.2 
 
 		 367 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  35.89 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  25.2 
 
 		 367 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  24.55 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  26.8 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  22.53 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  26.54 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  23.42 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  24.15 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  22.17 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  21.56 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  23.94 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  26.43 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.03 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  22.22 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  24.6 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  23.56 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  21.75 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  19.68 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  21.59 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  22.96 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  21.59 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25.29 
 
 		 564 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  22.83 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  23.04 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  22.83 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  21.38 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  23.71 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  25.46 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  33.62 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  22.96 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  24.6 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  24.42 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  22.96 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  20.88 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  21.5 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  23.85 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  23.26 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  24.5 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  22.37 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  21.45 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  27.09 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24.32 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  21.45 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  21.86 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  33.94 
 
 		 1191 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  21.24 
 
 		 370 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  21.75 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  33.65 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  23.68 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  35.78 
 
 		 1165 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  25.45 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  32.69 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  23.92 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  44.62 
 
 		 1141 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  56.52 
 
 		 1173 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  50.94 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  22.72 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.33 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  50.94 
 
 		 1176 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  50.94 
 
 		 1176 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  21.5 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1546  hypothetical protein  32.39 
 
 		 165 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  24.54 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  40.98 
 
 		 361 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  41.3 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  46.67 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  41.07 
 
 		 131 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  52.17 
 
 		 1403 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  30.48 
 
 		 1234 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  42.42 
 
 		 1133 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  34.02 
 
 		 1167 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  44.68 
 
 		 1192 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  32.73 
 
 		 1175 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  34.02 
 
 		 1167 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  43.08 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  51.85 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  21.77 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  34.02 
 
 		 1167 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  34.02 
 
 		 1167 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  30.69 
 
 		 1171 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  42.42 
 
 		 1140 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  45.1 
 
 		 131 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  27.83 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  43.94 
 
 		 1148 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  42.65 
 
 		 1139 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  32.69 
 
 		 1162 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  32.5 
 
 		 1175 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  42.65 
 
 		 1145 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  41.07 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  46.3 
 
 		 1187 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  30.69 
 
 		 1182 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.24 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  49.06 
 
 		 1190 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  41.25 
 
 		 1189 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  41.25 
 
 		 1189 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  41.25 
 
 		 1189 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>