24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1283 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1283  protein of unknown function DUF74  100 
 
 
277 aa  570  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2018  hypothetical protein  59.22 
 
 
274 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1683  hypothetical protein  59.22 
 
 
274 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1416  hypothetical protein  53.68 
 
 
275 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265711  normal  0.0385868 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0296  protein of unknown function DUF74  55.93 
 
 
290 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.157183  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11788  hypothetical protein  51.22 
 
 
262 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9814e-41  hitchhiker  0.00000283904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1282  hypothetical protein  32.64 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2019  hypothetical protein  29.05 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00266391  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1684  hypothetical protein  29.05 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275984  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  40.66 
 
 
108 aa  49.7  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  35.23 
 
 
105 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  37.84 
 
 
106 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  39.33 
 
 
112 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  35.58 
 
 
104 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  41.57 
 
 
105 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  36.78 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  38.2 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  40.68 
 
 
106 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  38.37 
 
 
108 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  40.68 
 
 
106 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  34.41 
 
 
108 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  44.44 
 
 
140 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  44.44 
 
 
140 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>