More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1206 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  100 
 
 
303 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  65.96 
 
 
285 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  64.89 
 
 
286 aa  361  9e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  63.48 
 
 
287 aa  355  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  63.83 
 
 
284 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  63.03 
 
 
284 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  55.02 
 
 
292 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  55.43 
 
 
294 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  48.86 
 
 
338 aa  242  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.51 
 
 
286 aa  234  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  50 
 
 
288 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  49.12 
 
 
304 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  49.65 
 
 
285 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  49.64 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  47.18 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  50.36 
 
 
282 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  50 
 
 
291 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.1 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  48.91 
 
 
288 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  48.28 
 
 
298 aa  205  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  46.86 
 
 
334 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  48.34 
 
 
296 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  44.56 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  43.77 
 
 
318 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  48.12 
 
 
289 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  43.18 
 
 
325 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.82 
 
 
314 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  46.98 
 
 
303 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  46.98 
 
 
303 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  46.98 
 
 
303 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  48.42 
 
 
280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
304 aa  189  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.85 
 
 
304 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  45.03 
 
 
308 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  47.55 
 
 
272 aa  185  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  44.1 
 
 
300 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.86 
 
 
287 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.36 
 
 
301 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  39.78 
 
 
297 aa  162  9e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  39.86 
 
 
304 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  40.28 
 
 
280 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  33.57 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  40.39 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  34.66 
 
 
345 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  38.97 
 
 
296 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.5 
 
 
287 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.98 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  37.73 
 
 
284 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  39.82 
 
 
293 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0476  HemK family modification methylase  40.09 
 
 
301 aa  139  7e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540191  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  33.57 
 
 
289 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  36.8 
 
 
300 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  36.8 
 
 
300 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.1 
 
 
289 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  36.04 
 
 
280 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.17 
 
 
288 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.69 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  36.53 
 
 
284 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  37.81 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  38.52 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  38.21 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  39.05 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  40.62 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  35.21 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.11 
 
 
285 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  36.97 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  40.53 
 
 
273 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  35.77 
 
 
280 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  38.29 
 
 
299 aa  132  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  34.26 
 
 
289 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  35.21 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.8 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03421  putative protein methyltransferase  30.45 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.783711  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  38.35 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.5 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.89 
 
 
314 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  35.21 
 
 
293 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  38.49 
 
 
287 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03531  putative protein methyltransferase  35.75 
 
 
293 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.854566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.63 
 
 
288 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  36.04 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  36.44 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  35.14 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  34.83 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  32.28 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.75 
 
 
286 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.91 
 
 
295 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  39.21 
 
 
281 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.38 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  36.1 
 
 
282 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 
286 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  38.75 
 
 
286 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  32.35 
 
 
273 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  32.41 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  33.82 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  35.81 
 
 
296 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  36.03 
 
 
297 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.68 
 
 
300 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>