More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1133 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  38.42 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  40 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 266 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 299 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  39.04 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 217 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 205 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 227 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 192 aa  84.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  34.95 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  31.31 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  34.23 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  32.5 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  33.17 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
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NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  57.14 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
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NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
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NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  45.98 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
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NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
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NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
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NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  33.89 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
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NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
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NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
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NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
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