156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1065 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  100 
 
 
544 aa  1110    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  34.17 
 
 
506 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  32.24 
 
 
527 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  31.07 
 
 
564 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  33.46 
 
 
508 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  34.58 
 
 
515 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  32.38 
 
 
535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  32.27 
 
 
523 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  33.12 
 
 
541 aa  220  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  30.33 
 
 
500 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  30.99 
 
 
518 aa  216  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  31.49 
 
 
571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  31.64 
 
 
521 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  34.95 
 
 
538 aa  210  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  30.24 
 
 
476 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  35.02 
 
 
485 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  31.34 
 
 
522 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  31.85 
 
 
643 aa  208  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  30.7 
 
 
542 aa  207  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  32.19 
 
 
545 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  31.39 
 
 
525 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  30.96 
 
 
515 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  32.91 
 
 
525 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  30.72 
 
 
524 aa  204  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  30.97 
 
 
542 aa  203  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  31.04 
 
 
551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  30.54 
 
 
518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  29.19 
 
 
521 aa  196  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  31.38 
 
 
495 aa  196  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  30.84 
 
 
511 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  30.84 
 
 
511 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  30.84 
 
 
511 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  30.99 
 
 
551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  31.25 
 
 
542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  29.37 
 
 
515 aa  183  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  30.11 
 
 
521 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  28.91 
 
 
507 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  29.61 
 
 
546 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  28.87 
 
 
597 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  32.27 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  31.63 
 
 
495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  27.91 
 
 
504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  29.85 
 
 
540 aa  174  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  32.05 
 
 
557 aa  174  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  28.84 
 
 
522 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  28.49 
 
 
518 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  38.41 
 
 
597 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  30.04 
 
 
537 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  38.4 
 
 
300 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  27.22 
 
 
504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  29.74 
 
 
535 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  31.2 
 
 
505 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  28.34 
 
 
532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  26.46 
 
 
505 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  28.6 
 
 
530 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  27.19 
 
 
499 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  30.1 
 
 
533 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  28.27 
 
 
506 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  30.1 
 
 
508 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  30.1 
 
 
508 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  30.85 
 
 
520 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  30.02 
 
 
484 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  28.98 
 
 
504 aa  158  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  28.63 
 
 
527 aa  153  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  27.82 
 
 
486 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  27.49 
 
 
505 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  28.3 
 
 
556 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  27.73 
 
 
522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  30.12 
 
 
521 aa  145  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  34.63 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  26.9 
 
 
539 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  28.36 
 
 
520 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  26.31 
 
 
546 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  25.57 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  25.25 
 
 
547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  25.97 
 
 
532 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  26.81 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  28.22 
 
 
536 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  28.21 
 
 
750 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 
555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
486 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  25.28 
 
 
678 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  25.1 
 
 
505 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  26.04 
 
 
499 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  27.79 
 
 
493 aa  123  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  26.93 
 
 
600 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 
525 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  25.4 
 
 
459 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  29.13 
 
 
524 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  31.47 
 
 
542 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  25.32 
 
 
494 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  31.73 
 
 
613 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  34.83 
 
 
480 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  26.4 
 
 
559 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  26.89 
 
 
475 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  27.25 
 
 
519 aa  99.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  34.72 
 
 
524 aa  98.2  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  29.07 
 
 
766 aa  95.9  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  25.14 
 
 
490 aa  94.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>