225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0884 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  66.06 
 
 		 482 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  65.19 
 
 		 463 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  100 
 
 		 570 aa  1152    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  65.45 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  65.59 
 
 		 495 aa  628  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  62.6 
 
 		 483 aa  611  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  61.48 
 
 		 483 aa  609  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  65.45 
 
 		 492 aa  602  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  60.64 
 
 		 507 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  62.14 
 
 		 503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  66.26 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.57 
 
 		 485 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  56.44 
 
 		 529 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  47.19 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  51.62 
 
 		 447 aa  357  3.9999999999999996e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  39.37 
 
 		 527 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  46.93 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  38.35 
 
 		 650 aa  280  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  41.3 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  44.34 
 
 		 539 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  42.28 
 
 		 539 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  41.57 
 
 		 535 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  41.57 
 
 		 538 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 328 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 341 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 265 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 284 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 284 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  42.39 
 
 		 255 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 240 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  36.08 
 
 		 254 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 347 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 		 254 aa  50.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 238 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 284 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.62 
 
 		 251 aa  50.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 239 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  37.84 
 
 		 258 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 251 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 		 303 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 		 233 aa  49.7  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 262 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 256 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 263 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 265 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1462  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 259 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780505  normal  0.472933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 237 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 292 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 331 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 289 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 247 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 		 317 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 		 293 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 268 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 247 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.63 
 
 		 247 aa  47.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4069  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 239 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 246 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 		 257 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35 
 
 		 249 aa  47  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 		 287 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.17 
 
 		 246 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.87 
 
 		 246 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0102101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 284 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  32.63 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 246 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 267 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 268 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.87 
 
 		 246 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 		 247 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 285 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 343 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.87 
 
 		 246 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28 
 
 		 245 aa  47  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.424888 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35 
 
 		 249 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 		 227 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 700 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 257 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 263 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.51 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.58 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2394  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 268 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.097477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 		 290 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 325 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 255 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>