More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0805 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
459 aa  900    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  37.2 
 
 
418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  33.25 
 
 
417 aa  216  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  34.73 
 
 
431 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 
429 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
432 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
410 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  33.9 
 
 
415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  30.77 
 
 
412 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
409 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
435 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 
420 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
442 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  29.2 
 
 
403 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  26.48 
 
 
424 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  26.48 
 
 
424 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
476 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
424 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.48 
 
 
420 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.23 
 
 
412 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
431 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
444 aa  91.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
428 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  26.9 
 
 
443 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  26.09 
 
 
443 aa  90.9  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
433 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.88 
 
 
413 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
455 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  23.19 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  23.36 
 
 
420 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  23.34 
 
 
474 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  22.95 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
494 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  30.34 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.69 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  22.77 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  22.72 
 
 
420 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  22.72 
 
 
420 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  23.02 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  24.67 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  25.41 
 
 
464 aa  79.7  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  25.64 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.35 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  24.56 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  28.14 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  26.2 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  23.68 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  30.7 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  18.6 
 
 
1833 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  23.27 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  24.12 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  24.12 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  24.12 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  24.12 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  24.12 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
440 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
428 aa  77  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 
425 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
418 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  24.86 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.84 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  24.86 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  26.37 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  25.59 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0364  sugar transporter  24.36 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.03 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  24.58 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.68 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  25.44 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  24.86 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  31.02 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.83 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
442 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  27.3 
 
 
457 aa  73.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  27.23 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
410 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 
407 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.48 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  24.56 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  25.21 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>