269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0789 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0789  adenosine deaminase  100 
 
 
367 aa  750    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  74.09 
 
 
359 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  73.48 
 
 
364 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  72.5 
 
 
364 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3533  adenosine deaminase  72.35 
 
 
373 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0451471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  71.63 
 
 
362 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3954  adenosine deaminase  73.18 
 
 
365 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  71.55 
 
 
364 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  68.44 
 
 
364 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  69.58 
 
 
360 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  68.33 
 
 
366 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  68.84 
 
 
362 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1320  adenosine deaminase  68.8 
 
 
363 aa  481  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0285514  normal  0.854573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  66.57 
 
 
363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  65.36 
 
 
367 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  66.76 
 
 
362 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  66.76 
 
 
362 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  66.48 
 
 
362 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  67.32 
 
 
362 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0976  adenosine deaminase  66.49 
 
 
375 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1781  adenosine deaminase  65.03 
 
 
369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13344  adenosine deaminase  64.23 
 
 
365 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.359069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  60.17 
 
 
372 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2936  adenosine deaminase  58.94 
 
 
372 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000510583  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  59.05 
 
 
356 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1002  adenosine deaminase  58.81 
 
 
367 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1145  adenosine deaminase  54.2 
 
 
381 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.605319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  56.94 
 
 
358 aa  360  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1027  adenosine deaminase  56.57 
 
 
371 aa  354  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1218  adenosine deaminase  53.83 
 
 
378 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000911946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4395  adenosine deaminase  55.71 
 
 
358 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  57.19 
 
 
360 aa  346  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04960  adenosine deaminase  51.61 
 
 
403 aa  317  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.567283  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28230  adenosine deaminase  40.23 
 
 
441 aa  270  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  42.98 
 
 
376 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  43.3 
 
 
374 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  42.41 
 
 
376 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  41.03 
 
 
376 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  43.32 
 
 
359 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  40.35 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1162  adenosine deaminase  32.26 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  34.11 
 
 
332 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  33.82 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  32.08 
 
 
346 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  32.34 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  31.1 
 
 
331 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  32.95 
 
 
366 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  33.63 
 
 
333 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  30.52 
 
 
331 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  33.63 
 
 
333 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  33.63 
 
 
333 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  33.63 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  33.63 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  33.63 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  33.63 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  33.63 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  33.63 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  31.78 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  31.38 
 
 
331 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0538  adenosine deaminase  30.77 
 
 
340 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000801372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  31.78 
 
 
332 aa  149  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  31.48 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  32.66 
 
 
334 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  30.09 
 
 
353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  30.23 
 
 
344 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  32.35 
 
 
337 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  35.19 
 
 
332 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  31.1 
 
 
331 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  32.14 
 
 
333 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  30.7 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  32.74 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  32.45 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  31.22 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  32.15 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  32.45 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0440  adenosine deaminase  33.74 
 
 
332 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  31.49 
 
 
334 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  32.45 
 
 
331 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  32.23 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  32.23 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  31.72 
 
 
334 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  32.23 
 
 
333 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  32.23 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  31.86 
 
 
331 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  32.15 
 
 
331 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0791  adenosine deaminase  30.12 
 
 
336 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  30.55 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  31.56 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  30.55 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  31.27 
 
 
331 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  31.86 
 
 
331 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  27.17 
 
 
331 aa  133  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  31.4 
 
 
332 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  30.77 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1406  adenosine deaminase  27.65 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000107989  hitchhiker  2.2737200000000002e-26 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  31.61 
 
 
337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  30.77 
 
 
337 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  28.03 
 
 
354 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  27.83 
 
 
326 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  30.77 
 
 
336 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>