More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0751 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_26090  GTP-binding protein TypA/BipA  71.14 
 
 
636 aa  913    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.876916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1268  GTP-binding protein TypA  67.66 
 
 
629 aa  870    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  77.81 
 
 
617 aa  962    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  73.88 
 
 
624 aa  905    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  53.95 
 
 
614 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  74.65 
 
 
629 aa  954    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  73.94 
 
 
630 aa  930    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  73.35 
 
 
613 aa  915    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1144  GTP-binding protein TypA  66.03 
 
 
635 aa  814    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  54.77 
 
 
616 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0480  GTP-binding protein TypA  62.12 
 
 
641 aa  797    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  55.45 
 
 
608 aa  678    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  56.98 
 
 
608 aa  703    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  69.79 
 
 
636 aa  887    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0246  membrane GTPase for stress response  62.28 
 
 
643 aa  802    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.107779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  79.45 
 
 
650 aa  994    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  70.14 
 
 
633 aa  896    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
630 aa  1280    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  66.61 
 
 
640 aa  824    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  75.44 
 
 
620 aa  958    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  77.11 
 
 
617 aa  975    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 
615 aa  651    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  80.73 
 
 
617 aa  1028    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0793  GTP-binding protein TypA  71.79 
 
 
635 aa  914    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 
616 aa  645    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  66.14 
 
 
636 aa  831    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  69.81 
 
 
642 aa  889    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  53.57 
 
 
615 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  72.32 
 
 
620 aa  908    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  52.18 
 
 
606 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11190  GTP-binding translation elongation factor typA  64.84 
 
 
628 aa  788    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2163  GTP-binding protein TypA  66.14 
 
 
642 aa  809    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 
605 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0759  GTP-binding protein TypA  68.74 
 
 
633 aa  861    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00250463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  78.47 
 
 
630 aa  1000    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4540  GTP-binding protein TypA  64.91 
 
 
634 aa  823    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 
594 aa  657    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 
615 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  55.45 
 
 
605 aa  679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4040  GTP-binding protein TypA  66.72 
 
 
633 aa  816    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11090  GTP-binding protein TypA/BipA  67.55 
 
 
640 aa  877    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0960389  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 
608 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  77.85 
 
 
641 aa  974    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  72.09 
 
 
645 aa  932    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  77.44 
 
 
622 aa  965    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  70.02 
 
 
620 aa  868    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0962  GTP-binding protein TypA  72.27 
 
 
645 aa  912    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0622618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4269  GTP-binding protein TypA  66.72 
 
 
633 aa  816    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  68.33 
 
 
642 aa  890    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  56.61 
 
 
594 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  53.66 
 
 
613 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  52.24 
 
 
612 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  75.24 
 
 
631 aa  952    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4115  GTP-binding protein TypA  66.72 
 
 
633 aa  816    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0578  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 
609 aa  634  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0310674  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  52.77 
 
 
593 aa  629  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  51.52 
 
 
610 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  51.77 
 
 
614 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  51.36 
 
 
610 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  51.37 
 
 
619 aa  623  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 
608 aa  618  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  50.96 
 
 
613 aa  621  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50.72 
 
 
608 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  50.16 
 
 
615 aa  617  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  49.76 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  49.76 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  49.76 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  49.76 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  49.76 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  49.76 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  49.76 
 
 
614 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  49.76 
 
 
614 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  51.97 
 
 
592 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  49.6 
 
 
614 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  49.13 
 
 
614 aa  611  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  49.13 
 
 
614 aa  608  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  50.72 
 
 
615 aa  610  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  50.81 
 
 
610 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  51.22 
 
 
614 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  50.56 
 
 
613 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  49.68 
 
 
613 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  49.43 
 
 
615 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  49.43 
 
 
615 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  48.63 
 
 
603 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  50.88 
 
 
627 aa  600  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  51.79 
 
 
595 aa  601  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  48.7 
 
 
602 aa  596  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  49.27 
 
 
607 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  50.32 
 
 
602 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4397  GTP-binding protein  49.27 
 
 
607 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 
595 aa  596  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  49.27 
 
 
607 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  49.27 
 
 
607 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  48.62 
 
 
602 aa  596  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  49.27 
 
 
607 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  48.46 
 
 
602 aa  595  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4502  GTP-binding protein TypA  48.96 
 
 
607 aa  594  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  47.97 
 
 
602 aa  594  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  49.04 
 
 
607 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  51.92 
 
 
608 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>