More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0692 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  75 
 
 		 243 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  63.6 
 
 		 279 aa  304  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  64.44 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  63.31 
 
 		 245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  62.08 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  64.5 
 
 		 256 aa  294  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  60.74 
 
 		 266 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  61.37 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  62.01 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  57.98 
 
 		 247 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  60 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  57.98 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  59.49 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  58.02 
 
 		 277 aa  275  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  60 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  55.65 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  57.45 
 
 		 455 aa  272  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 247 aa  271  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.08 
 
 		 280 aa  271  8.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  59.47 
 
 		 445 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  62.71 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  60.96 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  59.13 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  62.55 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  61.86 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  60.7 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  63.09 
 
 		 277 aa  268  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  54.89 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  58.47 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  58.62 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  57.81 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  56.97 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  64.32 
 
 		 257 aa  263  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  58.62 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  56.5 
 
 		 259 aa  260  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  53.72 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  57.46 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.17 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  57.39 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  56.6 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  59.11 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  57.83 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 279 aa  254  8e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  59.43 
 
 		 248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  54.94 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  58.01 
 
 		 312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.97 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  65.13 
 
 		 249 aa  252  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  59.19 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  53.91 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  56.05 
 
 		 244 aa  248  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  60.98 
 
 		 224 aa  248  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  57.64 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  57.09 
 
 		 247 aa  244  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  58.16 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.6 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  54.67 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  58.06 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  52.87 
 
 		 279 aa  240  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.7 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.42 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  56.65 
 
 		 293 aa  239  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  54.01 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.5 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  52.1 
 
 		 255 aa  228  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  49.78 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.7 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  54.67 
 
 		 235 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.56 
 
 		 653 aa  211  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  50 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.74 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  49.55 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.05 
 
 		 231 aa  208  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  50.88 
 
 		 245 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  49.52 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  48.17 
 
 		 658 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  42.59 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.87 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.82 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  43.95 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.29 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.25 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.5 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.49 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.43 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  47.95 
 
 		 234 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  48.33 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  49.79 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  42.37 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.77 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.03 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  48.04 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>