More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0664 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  100 
 
 
413 aa  817    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  65.32 
 
 
406 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  62.72 
 
 
402 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  64.5 
 
 
402 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  65.82 
 
 
403 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  65.74 
 
 
412 aa  458  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  63.04 
 
 
401 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  63.16 
 
 
404 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  63.09 
 
 
404 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  60.75 
 
 
402 aa  435  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1888  threonine dehydratase  62.5 
 
 
413 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  62.28 
 
 
403 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  59.19 
 
 
408 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  54.68 
 
 
412 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  57.87 
 
 
411 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  55.5 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  56.22 
 
 
405 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  57.47 
 
 
408 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0939  threonine dehydratase  62.37 
 
 
399 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  55.95 
 
 
400 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  46.72 
 
 
403 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  51.84 
 
 
443 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  48.63 
 
 
405 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  45.45 
 
 
403 aa  336  5e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  46.77 
 
 
403 aa  325  8.000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  45.24 
 
 
408 aa  324  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  42.35 
 
 
402 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  42.24 
 
 
402 aa  322  7e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  47.49 
 
 
403 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  47.34 
 
 
401 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  47.34 
 
 
401 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  43.22 
 
 
402 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  46.35 
 
 
403 aa  313  4.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  49.12 
 
 
403 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  45.57 
 
 
402 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  45.57 
 
 
403 aa  309  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  46.9 
 
 
410 aa  308  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  43.04 
 
 
401 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  43.18 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  47.99 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  41.41 
 
 
403 aa  307  3e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  47.99 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  48.21 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  44.61 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  41.88 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  42.89 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  46.55 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  47.74 
 
 
403 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  45.41 
 
 
414 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  44.36 
 
 
408 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  47.47 
 
 
407 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  48.89 
 
 
412 aa  300  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  45.71 
 
 
415 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  44.86 
 
 
415 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  40.26 
 
 
403 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  39.74 
 
 
403 aa  295  7e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  40.05 
 
 
403 aa  295  1e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  46.63 
 
 
402 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  38.25 
 
 
404 aa  293  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  46.02 
 
 
410 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  39.48 
 
 
403 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  42.31 
 
 
395 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  39.04 
 
 
403 aa  290  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  46.1 
 
 
411 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  46.42 
 
 
404 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  42.71 
 
 
399 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  46.5 
 
 
416 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  44.91 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  44.75 
 
 
413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  44.03 
 
 
421 aa  281  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  46.37 
 
 
402 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  46.27 
 
 
402 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  40.5 
 
 
406 aa  279  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  43.73 
 
 
409 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  45.41 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  45.52 
 
 
442 aa  273  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  41.85 
 
 
400 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  42.68 
 
 
403 aa  271  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  41.67 
 
 
400 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  41.6 
 
 
418 aa  267  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  44.42 
 
 
410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  37.82 
 
 
408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  39.04 
 
 
537 aa  265  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  41.74 
 
 
402 aa  262  6.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  41.81 
 
 
403 aa  260  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  42.68 
 
 
412 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  36.68 
 
 
401 aa  260  4e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  43.86 
 
 
399 aa  259  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  43.86 
 
 
399 aa  259  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  43.75 
 
 
403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  40.76 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  42.61 
 
 
402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.77 
 
 
320 aa  252  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  36.34 
 
 
416 aa  251  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  44.16 
 
 
403 aa  247  3e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  40.55 
 
 
415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  38.38 
 
 
504 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  37.84 
 
 
403 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.38 
 
 
504 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  37.08 
 
 
511 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>