12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0521 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0521  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  186  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.281693  normal  0.161001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7412  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0087  PilT protein domain protein  41.46 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2779  PilT protein domain protein  37.7 
 
 
141 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1339  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4093  PilT protein domain-containing protein  32.91 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10307  hypothetical protein  46.94 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000112369  normal  0.0967595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10669  hypothetical protein  29.49 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12547  hypothetical protein  33.68 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0120006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8949  hypothetical protein  40.35 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234545  normal  0.589918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  29.11 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  38.71 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>