More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0498 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  100 
 
 		 550 aa  1107    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  55.11 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  43.72 
 
 		 561 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  38.38 
 
 		 337 aa  212  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  38.7 
 
 		 333 aa  207  5e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  35.47 
 
 		 336 aa  195  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  36.97 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  37.05 
 
 		 335 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  36.41 
 
 		 338 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  37.46 
 
 		 346 aa  191  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  35.85 
 
 		 334 aa  191  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  38.1 
 
 		 338 aa  189  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  35.57 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  34.37 
 
 		 336 aa  188  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  36.54 
 
 		 336 aa  187  5e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  37.85 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  35.29 
 
 		 337 aa  186  9e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  36.72 
 
 		 337 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  35.29 
 
 		 334 aa  183  6e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  35.57 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  35.52 
 
 		 332 aa  178  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  33.88 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  36.16 
 
 		 337 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  30.33 
 
 		 429 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  33.62 
 
 		 423 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  32.53 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  32.95 
 
 		 434 aa  128  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  31.69 
 
 		 430 aa  128  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  30.26 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  31.7 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  31.3 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  31.3 
 
 		 430 aa  127  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  34.1 
 
 		 428 aa  127  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  33.04 
 
 		 430 aa  126  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  32.3 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  33.14 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  30.47 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  33.43 
 
 		 807 aa  124  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  33.33 
 
 		 431 aa  123  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  32.46 
 
 		 428 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  31.59 
 
 		 429 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  31.2 
 
 		 429 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  31.79 
 
 		 427 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  32.27 
 
 		 429 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  29.15 
 
 		 428 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  33.62 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  28.91 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  32.47 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  32.17 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  31.05 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  30.29 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  31.59 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  31.5 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  34.29 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  31.14 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  31.4 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  33.24 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  32.8 
 
 		 427 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  32.09 
 
 		 429 aa  120  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  33.05 
 
 		 451 aa  120  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  31.79 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  31.7 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  30.68 
 
 		 427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  32.86 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  32.66 
 
 		 436 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  31.29 
 
 		 419 aa  118  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 427 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  31.28 
 
 		 428 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  32.47 
 
 		 430 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  29.68 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  31.58 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  31.99 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  30.55 
 
 		 430 aa  117  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2198  adenylosuccinate synthetase  30.86 
 
 		 443 aa  117  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  32.18 
 
 		 430 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  32.36 
 
 		 430 aa  117  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  31.88 
 
 		 432 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  30.26 
 
 		 427 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  32.75 
 
 		 427 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  31.41 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  28.67 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  28.5 
 
 		 438 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  31.91 
 
 		 435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  30.7 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  32.08 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  31.12 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  31.2 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  31.2 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  31.28 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  28.95 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  33.04 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  31.12 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  31.2 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  31.92 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  31.12 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  31.2 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  31.18 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5009  adenylosuccinate synthetase  27.07 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  28.27 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>