More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0474 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  100 
 
 		 494 aa  947    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  88.44 
 
 		 380 aa  358  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  69.31 
 
 		 333 aa  289  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  73.94 
 
 		 334 aa  289  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  72.11 
 
 		 767 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  68.84 
 
 		 338 aa  287  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  70.74 
 
 		 343 aa  276  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  67.17 
 
 		 233 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  62.98 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  72.16 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  61.79 
 
 		 688 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  66.67 
 
 		 692 aa  251  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  63 
 
 		 1001 aa  249  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  60.42 
 
 		 411 aa  246  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  71.08 
 
 		 778 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  62.36 
 
 		 225 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  60.87 
 
 		 221 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  75.39 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  56.59 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  55.12 
 
 		 212 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  54.63 
 
 		 212 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  52.5 
 
 		 1160 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  52.97 
 
 		 337 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  46.93 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  64.39 
 
 		 1148 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  48.54 
 
 		 683 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  50.25 
 
 		 356 aa  194  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  50.25 
 
 		 298 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  58.29 
 
 		 672 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  51.69 
 
 		 788 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  59.34 
 
 		 753 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  58.02 
 
 		 727 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  64.42 
 
 		 935 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  57.43 
 
 		 376 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  56 
 
 		 884 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  60.4 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  51.69 
 
 		 3244 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  51.14 
 
 		 2079 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  55.88 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  35.71 
 
 		 2402 aa  120  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  58.82 
 
 		 775 aa  114  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  49.61 
 
 		 1007 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  63.46 
 
 		 622 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  55.45 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  54.9 
 
 		 925 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  50.98 
 
 		 743 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  53.76 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  56.86 
 
 		 487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  47.51 
 
 		 1779 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  53.92 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  68.6 
 
 		 815 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  39.9 
 
 		 221 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.85 
 
 		 998 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.06 
 
 		 984 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 		 875 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  48.21 
 
 		 628 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  50 
 
 		 609 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.94 
 
 		 588 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  56.38 
 
 		 938 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  52.88 
 
 		 623 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  52.88 
 
 		 842 aa  104  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  52.94 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  50.98 
 
 		 596 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  51.43 
 
 		 894 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  48.15 
 
 		 851 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  54.35 
 
 		 1209 aa  103  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  49.02 
 
 		 681 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  52.94 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  49.52 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  49.5 
 
 		 773 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  44.23 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  47.22 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  48.87 
 
 		 681 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.92 
 
 		 979 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  47.06 
 
 		 812 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50.5 
 
 		 767 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 913 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  68.75 
 
 		 962 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  53.26 
 
 		 763 aa  100  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  47.52 
 
 		 1128 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  50 
 
 		 533 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 		 854 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  51.06 
 
 		 487 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  48.54 
 
 		 589 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  47.12 
 
 		 846 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  48.51 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  45.37 
 
 		 934 aa  98.2  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  53.01 
 
 		 456 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  44.66 
 
 		 633 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  50.98 
 
 		 446 aa  97.8  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  47.06 
 
 		 442 aa  97.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.54 
 
 		 499 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  45.63 
 
 		 864 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  53.01 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  47.97 
 
 		 743 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  49.51 
 
 		 580 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  55.95 
 
 		 1298 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  51.09 
 
 		 403 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  57.5 
 
 		 1137 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  50 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>