More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0468 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 223 aa  440  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  62.05 
 
 		 227 aa  261  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.11 
 
 		 228 aa  261  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 229 aa  257  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  60.09 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  61.23 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  61.23 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  61.23 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  59.91 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  58.75 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  60.09 
 
 		 231 aa  254  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  58.48 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  62.72 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.32 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  58.59 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.86 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  58.95 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  54.87 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.82 
 
 		 223 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.67 
 
 		 228 aa  226  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  54.11 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.45 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.06 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.73 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  51.34 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  52.44 
 
 		 406 aa  215  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  53.15 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 248 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  50.22 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  55.31 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.14 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 248 aa  201  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  47.98 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  54.42 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.21 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 244 aa  197  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  47.56 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.13 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  50 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5196  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.19 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  47.32 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  43.81 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 231 aa  194  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.84 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 232 aa  192  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  45.33 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 223 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 243 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  46.22 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  42.6 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.73 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  42.92 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>