32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0452 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 525 aa  991    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  43.86 
 
 		 485 aa  94  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  44.31 
 
 		 486 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  32.1 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3874  hypothetical protein  42.19 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172055  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2764  hypothetical protein  40.68 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  40.24 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  53.26 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  42.24 
 
 		 1241 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2881  hypothetical protein  36.09 
 
 		 445 aa  67  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  40.46 
 
 		 808 aa  66.6  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  35.67 
 
 		 882 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  37.58 
 
 		 631 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  31.67 
 
 		 1490 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2379  hypothetical protein  33.12 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.262289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  37.04 
 
 		 6272 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  49.33 
 
 		 1383 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0450  hypothetical protein  34.53 
 
 		 167 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  30.53 
 
 		 615 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  42.31 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1769  hypothetical protein  32.16 
 
 		 171 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  45.98 
 
 		 1478 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  37.57 
 
 		 870 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0459  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.3 
 
 		 1193 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245222  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0072  hypothetical protein  34.78 
 
 		 332 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1278 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01070  hypothetical protein  32.61 
 
 		 215 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  36.64 
 
 		 1275 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  29 
 
 		 791 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.10709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0920  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  28.83 
 
 		 509 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  34.43 
 
 		 3325 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.45 
 
 		 1251 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>