118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0346 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  63.11 
 
 		 224 aa  251  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  62.62 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  65.92 
 
 		 213 aa  242  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  64.04 
 
 		 212 aa  238  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  62.3 
 
 		 227 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  62.28 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 229 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  53.47 
 
 		 202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  51.64 
 
 		 213 aa  211  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 203 aa  201  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  51.44 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  61.14 
 
 		 272 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  49.01 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  60.45 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  56.45 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  61.36 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  52 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  57.39 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  47.75 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 187 aa  168  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 181 aa  168  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  53.55 
 
 		 180 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  54.65 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  52.66 
 
 		 252 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  48.47 
 
 		 199 aa  141  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  28.19 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  43.75 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.71 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  24.12 
 
 		 165 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  23.53 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 121 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  48.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 112 aa  48.1  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  27.86 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  40 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  24 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  36.05 
 
 		 107 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  24 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  27.44 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 372 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  27.74 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  32.05 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  25.51 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  27.45 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 277 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  34.85 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  22.4 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  34.41 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  27.32 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  24.42 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  24.42 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  24.42 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  28.83 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  26.51 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  37.35 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  29.85 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>