More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0334 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
151 aa  294  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  65.99 
 
 
148 aa  200  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  65.99 
 
 
148 aa  197  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  62.59 
 
 
148 aa  190  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  59.31 
 
 
148 aa  188  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  59.31 
 
 
148 aa  186  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  62.59 
 
 
148 aa  186  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  60.54 
 
 
148 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  61.22 
 
 
148 aa  185  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  64.83 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  62.59 
 
 
150 aa  177  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  58.5 
 
 
149 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  56.46 
 
 
149 aa  174  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  59.06 
 
 
151 aa  173  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  59.86 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  57.14 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  60.26 
 
 
151 aa  169  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  59.18 
 
 
148 aa  167  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  59.73 
 
 
151 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  56.16 
 
 
151 aa  158  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  57.82 
 
 
148 aa  155  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  51.68 
 
 
157 aa  155  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 
152 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 
152 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  57.62 
 
 
151 aa  155  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 
152 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  58.11 
 
 
150 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  54 
 
 
150 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  54.11 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  52.35 
 
 
152 aa  152  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  56.76 
 
 
150 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  54.11 
 
 
150 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  55.78 
 
 
153 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  52.35 
 
 
152 aa  147  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  52.35 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  47.65 
 
 
151 aa  135  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  46 
 
 
148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.84 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  45.33 
 
 
148 aa  122  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  40 
 
 
170 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 
148 aa  118  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.06 
 
 
147 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
147 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
147 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  43.06 
 
 
178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.41 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
148 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
148 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
147 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
149 aa  110  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
151 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  42.18 
 
 
146 aa  110  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  41.67 
 
 
191 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
168 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
151 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
147 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
171 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  42.07 
 
 
181 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  36.55 
 
 
149 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
189 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  35.17 
 
 
148 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  37.76 
 
 
193 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
189 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
148 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  37.06 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
150 aa  101  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  36.81 
 
 
149 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
189 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
167 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  42.07 
 
 
150 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  32.88 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  39.58 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
167 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  40.74 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.93 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  33.79 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 
194 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
188 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 
209 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  37.42 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
195 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>