42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0295 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0295  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0093  hypothetical protein  40.86 
 
 
270 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7211  hypothetical protein  44.94 
 
 
336 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3341  hypothetical protein  64.13 
 
 
151 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6865  hypothetical protein  61.29 
 
 
125 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.915134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8989  hypothetical protein  56.86 
 
 
166 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0162  hypothetical protein  58.06 
 
 
117 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37920  hypothetical protein  59.14 
 
 
126 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0943  hypothetical protein  61.7 
 
 
138 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.506387  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2358  hypothetical protein  59.78 
 
 
128 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.146977  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2073  hypothetical protein  46.21 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4764  hypothetical protein  60.87 
 
 
126 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3409  hypothetical protein  55.43 
 
 
137 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2746  hypothetical protein  55.79 
 
 
169 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18580  hypothetical protein  56.99 
 
 
133 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3190  hypothetical protein  52.63 
 
 
125 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34170  hypothetical protein  53.19 
 
 
129 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4386  hypothetical protein  55.43 
 
 
158 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4042  hypothetical protein  58.06 
 
 
130 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0080091  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0302  hypothetical protein  64.86 
 
 
146 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06030  hypothetical protein  54.26 
 
 
138 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.824286  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08930  hypothetical protein  55.32 
 
 
140 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2910  hypothetical protein  56.99 
 
 
125 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3525  hypothetical protein  53.61 
 
 
133 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6144  hypothetical protein  54.74 
 
 
115 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645069  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3092  hypothetical protein  55.56 
 
 
123 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3577  hypothetical protein  58.75 
 
 
126 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.345774  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4629  hypothetical protein  51.55 
 
 
130 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4925  hypothetical protein  51.55 
 
 
130 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4542  hypothetical protein  51.55 
 
 
130 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.791465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5050  hypothetical protein  51.61 
 
 
125 aa  96.3  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10822  hypothetical protein  51.58 
 
 
129 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4320  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  95.5  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.406277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1633  hypothetical protein  51.55 
 
 
129 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5115  hypothetical protein  52.13 
 
 
149 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104477  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0690  hypothetical protein  28.24 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0022  hypothetical protein  43.33 
 
 
138 aa  77.8  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1391  hypothetical protein  41.49 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3739  hypothetical protein  30.43 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0277014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32190  hypothetical protein  27.44 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.648971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2113  hypothetical protein  26.32 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3837  hypothetical protein  42.37 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>