More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0277 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0277  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 594 aa  1159    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0388  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00816882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1264  major facilitator superfamily MFS_1  40.13 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3033  major facilitator family transporter  42.28 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7238  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 		 474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1266  MFS family transporter  42.28 
 
 		 476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein, putative  41.26 
 
 		 482 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 502 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 		 540 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  29.36 
 
 		 498 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.5 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 		 514 aa  104  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  27.93 
 
 		 481 aa  104  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 474 aa  103  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 488 aa  103  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  27.78 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 465 aa  102  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 		 523 aa  102  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.4 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  33.45 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.72 
 
 		 558 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2892  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 477 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  26.86 
 
 		 487 aa  99.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 467 aa  99.8  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.44 
 
 		 469 aa  98.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.78 
 
 		 475 aa  98.6  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.36 
 
 		 558 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  25.8 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 482 aa  97.8  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  27.12 
 
 		 508 aa  98.2  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 		 493 aa  97.8  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 		 478 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 524 aa  97.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  30.54 
 
 		 540 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  26.02 
 
 		 470 aa  97.4  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  27.96 
 
 		 453 aa  97.4  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 		 486 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.14 
 
 		 474 aa  97.4  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 		 486 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 489 aa  97.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 		 486 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 458 aa  97.1  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 504 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 		 486 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 		 486 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 		 486 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 523 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5226  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 		 484 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 516 aa  96.3  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  29.39 
 
 		 445 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 526 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 526 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.26 
 
 		 531 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.61 
 
 		 473 aa  95.9  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 530 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.31 
 
 		 501 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 462 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.85 
 
 		 509 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.46 
 
 		 505 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 		 492 aa  94.4  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.44 
 
 		 635 aa  94  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.59 
 
 		 471 aa  94  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.66 
 
 		 531 aa  94  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.3 
 
 		 531 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.3 
 
 		 531 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.33 
 
 		 502 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.3 
 
 		 531 aa  93.6  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.3 
 
 		 549 aa  94  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 460 aa  93.6  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 522 aa  93.6  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 478 aa  93.6  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 		 482 aa  93.2  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.3 
 
 		 549 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 484 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.89 
 
 		 575 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 474 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.98 
 
 		 528 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  27.3 
 
 		 531 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.73 
 
 		 509 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  27.3 
 
 		 531 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 524 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.63 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 		 508 aa  92  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.63 
 
 		 527 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.82 
 
 		 514 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>