More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0199 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  100 
 
 
452 aa  886    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  44.6 
 
 
442 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  38.65 
 
 
433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  40.1 
 
 
430 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.55 
 
 
405 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  44.26 
 
 
416 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  39.41 
 
 
429 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  42.25 
 
 
439 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
438 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.92 
 
 
415 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
418 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  37.85 
 
 
438 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  40.15 
 
 
463 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  39.25 
 
 
429 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  38.62 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  40.41 
 
 
434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.53 
 
 
403 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  40.29 
 
 
383 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  40.59 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  37.99 
 
 
434 aa  195  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  36.58 
 
 
410 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  41.85 
 
 
489 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  39.51 
 
 
442 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
492 aa  193  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  43.75 
 
 
412 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53 
 
 
586 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.19 
 
 
395 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  39.28 
 
 
420 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 
466 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 
435 aa  187  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.95 
 
 
461 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  36.47 
 
 
476 aa  182  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.12 
 
 
386 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  39.7 
 
 
402 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  48.54 
 
 
624 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43 
 
 
459 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
433 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
405 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  47.75 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.75 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.75 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  38.57 
 
 
410 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  38.83 
 
 
463 aa  172  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 
445 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 
375 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.49 
 
 
432 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  49.39 
 
 
444 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  41.57 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.93 
 
 
508 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
465 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 
343 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 
417 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  53.02 
 
 
454 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  49.75 
 
 
429 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 
445 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
388 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  36.76 
 
 
419 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 
621 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  47.91 
 
 
374 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  47.44 
 
 
237 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
408 aa  146  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
447 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 
431 aa  142  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
408 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  34.31 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  39.78 
 
 
365 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  35.99 
 
 
426 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
411 aa  136  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
587 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
422 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
382 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  42.08 
 
 
580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
398 aa  130  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
565 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
725 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
594 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
537 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  36.48 
 
 
453 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  35.19 
 
 
489 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  35.11 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  37.17 
 
 
689 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  36.94 
 
 
338 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  36.44 
 
 
373 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
618 aa  96.3  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  33.79 
 
 
459 aa  95.9  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  27.68 
 
 
287 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  32.26 
 
 
325 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  32.3 
 
 
368 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  30.04 
 
 
525 aa  94  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>