More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0156 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  100 
 
 
528 aa  1078    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  51.04 
 
 
508 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  45.72 
 
 
536 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  47.46 
 
 
515 aa  448  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  36.12 
 
 
512 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  33.39 
 
 
487 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  32.66 
 
 
496 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  32.29 
 
 
625 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  30.93 
 
 
527 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  32.93 
 
 
486 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  30.22 
 
 
679 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  29.69 
 
 
536 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.35 
 
 
490 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  30.53 
 
 
510 aa  207  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  29.54 
 
 
551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  31.5 
 
 
523 aa  200  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  31.8 
 
 
505 aa  199  7.999999999999999e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  31.03 
 
 
528 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  29.98 
 
 
506 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  32.32 
 
 
516 aa  191  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  29.14 
 
 
569 aa  190  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  30.61 
 
 
488 aa  190  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  28.52 
 
 
499 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  28.6 
 
 
547 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  29.83 
 
 
519 aa  183  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  30.14 
 
 
631 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  31.42 
 
 
502 aa  178  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  31.42 
 
 
502 aa  178  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  30.97 
 
 
519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  26.01 
 
 
514 aa  173  7.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  31.93 
 
 
625 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  30 
 
 
532 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  31.2 
 
 
647 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  30.08 
 
 
677 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  30.37 
 
 
706 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  30.04 
 
 
504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  29.8 
 
 
519 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  25.35 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  29.92 
 
 
533 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  29.8 
 
 
516 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.03 
 
 
579 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  29.64 
 
 
516 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  29.64 
 
 
516 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  29.64 
 
 
516 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  29.8 
 
 
529 aa  162  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  29.64 
 
 
516 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  29.45 
 
 
516 aa  161  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  29.74 
 
 
529 aa  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  28.96 
 
 
535 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  29.74 
 
 
529 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  30.41 
 
 
536 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  30.41 
 
 
536 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.41 
 
 
586 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  24.75 
 
 
513 aa  160  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.41 
 
 
536 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.41 
 
 
536 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.41 
 
 
536 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  31.49 
 
 
708 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  29.45 
 
 
535 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  28.13 
 
 
464 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  28.44 
 
 
760 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  29.02 
 
 
535 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  29.02 
 
 
535 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  26.1 
 
 
522 aa  155  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  31.68 
 
 
676 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.87 
 
 
591 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  29.6 
 
 
698 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  26.93 
 
 
470 aa  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  29.23 
 
 
471 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  30.83 
 
 
570 aa  151  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  28.71 
 
 
531 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  29.22 
 
 
687 aa  149  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  26.9 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  28.19 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  26.75 
 
 
470 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  26.75 
 
 
470 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  26.75 
 
 
470 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  26.75 
 
 
470 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  28.19 
 
 
532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  26.75 
 
 
470 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  26.75 
 
 
470 aa  147  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  26.75 
 
 
470 aa  147  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  26.75 
 
 
470 aa  147  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  26.16 
 
 
538 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  32.19 
 
 
542 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  28.28 
 
 
628 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  26.45 
 
 
470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  26.9 
 
 
471 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  34.01 
 
 
643 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  26.97 
 
 
470 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  26.24 
 
 
470 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  26.24 
 
 
470 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  26.24 
 
 
470 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  30.53 
 
 
620 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  26.24 
 
 
533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  26.72 
 
 
474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  26.72 
 
 
474 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  26.57 
 
 
471 aa  137  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  26.72 
 
 
474 aa  136  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  25.13 
 
 
877 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>