54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0104 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  100 
 
 
424 aa  857    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  36.15 
 
 
401 aa  238  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  33.97 
 
 
431 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  33.49 
 
 
426 aa  219  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  33.25 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  34.77 
 
 
424 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  34.65 
 
 
426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  31.04 
 
 
422 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 
400 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  32.73 
 
 
413 aa  203  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  34.48 
 
 
430 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  33.68 
 
 
415 aa  202  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  31.43 
 
 
427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  33.33 
 
 
434 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  35.11 
 
 
475 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  32.63 
 
 
429 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  30.3 
 
 
442 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  32.32 
 
 
448 aa  179  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  30.07 
 
 
423 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  31.62 
 
 
407 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  27.08 
 
 
420 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  29.74 
 
 
393 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  31.35 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  30.93 
 
 
412 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  28.61 
 
 
450 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  33.73 
 
 
500 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  32.88 
 
 
403 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  32.76 
 
 
367 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  31.71 
 
 
426 aa  146  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  28.61 
 
 
431 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  29.36 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  26.65 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  27.03 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  27.02 
 
 
344 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  28.1 
 
 
413 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  31.06 
 
 
366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  25.97 
 
 
432 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  27.37 
 
 
599 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  34.47 
 
 
351 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  30.08 
 
 
418 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  26.91 
 
 
600 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  27.57 
 
 
465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  26.49 
 
 
380 aa  100  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  27.42 
 
 
385 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  27.32 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  27.03 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  24.58 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  29.28 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  24.56 
 
 
560 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6054  proteinase inhibitor I4 serpin  26.22 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  26.67 
 
 
421 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1463  proteinase inhibitor I4 serpin  25 
 
 
417 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.330971  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0689  Serine protease inhibitor-like protein  48.53 
 
 
88 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.165227  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0801  proteinase inhibitor I4, serpin  23.13 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>