More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0100 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 564 aa  1082    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  41.55 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  42.58 
 
 		 553 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  42.2 
 
 		 555 aa  317  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  39.16 
 
 		 539 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  41.06 
 
 		 531 aa  313  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  38.92 
 
 		 541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  38.26 
 
 		 534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  39.65 
 
 		 539 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  36.6 
 
 		 536 aa  295  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  38.64 
 
 		 549 aa  289  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  38.13 
 
 		 522 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  41.25 
 
 		 510 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  38.75 
 
 		 518 aa  263  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  39.16 
 
 		 539 aa  260  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.63 
 
 		 585 aa  256  6e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  38.03 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  36.99 
 
 		 592 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  46.2 
 
 		 290 aa  217  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  45.68 
 
 		 325 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  46.01 
 
 		 312 aa  209  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  45.29 
 
 		 293 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  47.04 
 
 		 311 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  41.59 
 
 		 288 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  45.74 
 
 		 308 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  28.89 
 
 		 549 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  47.27 
 
 		 312 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  44.24 
 
 		 286 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  36.84 
 
 		 499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  44.55 
 
 		 298 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  42.24 
 
 		 285 aa  186  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  45.34 
 
 		 282 aa  186  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  34.76 
 
 		 506 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  47.02 
 
 		 285 aa  184  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  36.91 
 
 		 309 aa  178  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  41.64 
 
 		 282 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  38.2 
 
 		 298 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  38.99 
 
 		 292 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  38.99 
 
 		 292 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  38.99 
 
 		 292 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  48.15 
 
 		 204 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  40.87 
 
 		 288 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  40.87 
 
 		 288 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  38.12 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  35.96 
 
 		 309 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  47.58 
 
 		 233 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  37.81 
 
 		 300 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  34.59 
 
 		 310 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  35.33 
 
 		 316 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  32 
 
 		 334 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  35.33 
 
 		 316 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  34.62 
 
 		 350 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  37.58 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  46.51 
 
 		 203 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  35.02 
 
 		 316 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  46.7 
 
 		 209 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  34.62 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.23 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.34 
 
 		 348 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  41.84 
 
 		 248 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  37.77 
 
 		 323 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  35.24 
 
 		 359 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  35.24 
 
 		 359 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  35.24 
 
 		 359 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  35.24 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  35.24 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  35.24 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  35.24 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  34.02 
 
 		 350 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  46.52 
 
 		 235 aa  150  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  35.56 
 
 		 339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  35.19 
 
 		 314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  38.82 
 
 		 355 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  46.33 
 
 		 203 aa  148  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  36.47 
 
 		 355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  35.22 
 
 		 310 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  34.07 
 
 		 310 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  34.07 
 
 		 310 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  45.33 
 
 		 221 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  45.33 
 
 		 221 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  34.07 
 
 		 310 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  45.33 
 
 		 221 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  34.07 
 
 		 310 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  35.04 
 
 		 356 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  36.2 
 
 		 339 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  35.33 
 
 		 356 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  33.96 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  60.16 
 
 		 205 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  35.71 
 
 		 355 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  35.71 
 
 		 355 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  35.71 
 
 		 355 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  50.84 
 
 		 200 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  35.29 
 
 		 353 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  35.69 
 
 		 330 aa  144  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  35.26 
 
 		 355 aa  143  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  42.33 
 
 		 203 aa  143  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  27.13 
 
 		 321 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  29.01 
 
 		 343 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  56.92 
 
 		 203 aa  141  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  34.17 
 
 		 310 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>