More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0067 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  51.22 
 
 
657 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  53.44 
 
 
647 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 
652 aa  638    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  54.05 
 
 
649 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 
644 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  52.99 
 
 
644 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.66 
 
 
656 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  53.02 
 
 
648 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  54.59 
 
 
645 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  52.18 
 
 
651 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  65.99 
 
 
651 aa  848    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  52.25 
 
 
650 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
660 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  52.5 
 
 
651 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  52.44 
 
 
654 aa  656    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  70.73 
 
 
656 aa  978    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.07 
 
 
658 aa  716    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  50.15 
 
 
660 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.92 
 
 
655 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  52.94 
 
 
652 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  56.1 
 
 
657 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
660 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 
657 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 
660 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  53.85 
 
 
645 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  53.7 
 
 
651 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  52.21 
 
 
660 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  54.46 
 
 
667 aa  707    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  55.42 
 
 
673 aa  715    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.31 
 
 
666 aa  696    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.42 
 
 
657 aa  692    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  70.03 
 
 
715 aa  948    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.88 
 
 
661 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.53 
 
 
653 aa  699    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  54.15 
 
 
650 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.29 
 
 
660 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.96 
 
 
656 aa  723    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  53.67 
 
 
646 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  51.91 
 
 
660 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  54.29 
 
 
667 aa  671    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  54.3 
 
 
652 aa  655    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  52.18 
 
 
651 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  70.18 
 
 
661 aa  936    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.76 
 
 
660 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  53.49 
 
 
645 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  53.62 
 
 
645 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  53.64 
 
 
647 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  51.91 
 
 
654 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  67.66 
 
 
653 aa  883    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.61 
 
 
658 aa  711    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  52.2 
 
 
660 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.07 
 
 
660 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  54.31 
 
 
649 aa  731    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  54.78 
 
 
650 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  53.45 
 
 
650 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  53.12 
 
 
652 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
660 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
660 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  55.25 
 
 
652 aa  711    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  56.57 
 
 
655 aa  722    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
660 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  51.06 
 
 
664 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 
660 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  69.59 
 
 
660 aa  909    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  57.39 
 
 
644 aa  705    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  53.92 
 
 
658 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  52.65 
 
 
654 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  67.34 
 
 
663 aa  887    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.2 
 
 
655 aa  703    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  54.5 
 
 
644 aa  653    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  50.55 
 
 
652 aa  647    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  53.21 
 
 
645 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
660 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
660 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  52.52 
 
 
660 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  52.05 
 
 
664 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  55.08 
 
 
645 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  54.92 
 
 
645 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  55.97 
 
 
670 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  67.22 
 
 
673 aa  839    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  66.36 
 
 
676 aa  852    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 
660 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  51.06 
 
 
664 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  54.78 
 
 
673 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  53.38 
 
 
670 aa  681    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  51.46 
 
 
660 aa  652    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
660 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  51.91 
 
 
650 aa  643    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  53.29 
 
 
658 aa  700    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  53.04 
 
 
644 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  67.77 
 
 
654 aa  870    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  65.02 
 
 
657 aa  865    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.87 
 
 
667 aa  703    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.3 
 
 
660 aa  695    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  54.46 
 
 
645 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  51.79 
 
 
638 aa  635    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  69.71 
 
 
664 aa  892    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  60.63 
 
 
656 aa  783    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.66 
 
 
661 aa  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  69.59 
 
 
660 aa  909    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>