231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0066 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 433 aa  853    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  50.24 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  50.25 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  48.58 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  49.26 
 
 		 408 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  48.33 
 
 		 453 aa  345  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  47.74 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.77 
 
 		 436 aa  343  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  46.87 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  50.38 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.46 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  47.95 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  49.41 
 
 		 462 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  51.97 
 
 		 463 aa  325  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.24 
 
 		 441 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.24 
 
 		 450 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  47 
 
 		 450 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  48.67 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  48.48 
 
 		 434 aa  319  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  48.57 
 
 		 461 aa  318  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  47.34 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  46.84 
 
 		 402 aa  316  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  48.24 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.76 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.77 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  50.66 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.65 
 
 		 464 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.8 
 
 		 447 aa  299  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  46.41 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  44.89 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.12 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  47.97 
 
 		 431 aa  269  8e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  46.13 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.92 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.92 
 
 		 389 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.92 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.92 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 455 aa  257  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.64 
 
 		 389 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  46.76 
 
 		 539 aa  251  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  45.43 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.47 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  42.75 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  37.79 
 
 		 382 aa  245  9e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.39 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  40.31 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  37.37 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.64 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.64 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  38.06 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  47.63 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  39.64 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  40.91 
 
 		 426 aa  239  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  37.89 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.59 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  36.74 
 
 		 424 aa  237  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.92 
 
 		 391 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  39.9 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.9 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.06 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.65 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  37.31 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  36.81 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.08 
 
 		 391 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  38.66 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  36.28 
 
 		 470 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.81 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.45 
 
 		 399 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  39.46 
 
 		 392 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.28 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.28 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.28 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.28 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.28 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.75 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.95 
 
 		 399 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.73 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  35.66 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.99 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.99 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.67 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.99 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.99 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  42.99 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.99 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.99 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.99 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  38.88 
 
 		 876 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.38 
 
 		 394 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.34 
 
 		 399 aa  226  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  40.15 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  42.69 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.11 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.11 
 
 		 394 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  37.05 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  35.75 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.6 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.22 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  33.84 
 
 		 386 aa  223  7e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>