More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0064 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.27 
 
 
217 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.24 
 
 
221 aa  132  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.09 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 
216 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  32.89 
 
 
224 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  30.1 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  28.77 
 
 
224 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  28.87 
 
 
223 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.61 
 
 
224 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  38.19 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  38.19 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  29.59 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  38.19 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.19 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  38.19 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  38.19 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  30.1 
 
 
224 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  36.5 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  36.5 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  36.5 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  36.5 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  36.5 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  40.31 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  40.31 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  28.87 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
224 aa  82  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  33.99 
 
 
229 aa  82  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  40.31 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  35.29 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  37.01 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.68 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  34.44 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  31.79 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  37.01 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.22 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  33.33 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  36.22 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  32.68 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  31.15 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  36.22 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  34.81 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  38.39 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  33.82 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  32.45 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.22 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.05 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.34 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.33 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  37.5 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  34.09 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.43 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.33 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  30.59 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.75 
 
 
217 aa  72  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.26 
 
 
228 aa  72  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  30 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  34.15 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  27.07 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3065  HAD family hydrolase  32.76 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.78 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  33.98 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  27.85 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  31.43 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0472  HAD family hydrolase  26.98 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.523945  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  32.26 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  34.41 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  31.13 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  29.72 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  35.66 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  31.43 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  33.01 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.63 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  33.01 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.62 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  32.04 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  31.88 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3292  HAD family hydrolase  32.76 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125933 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  23.53 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.9 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  30.95 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  32.04 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  32.04 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.01 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  23.35 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  27.69 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  38.61 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.84 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>