138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0060 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  43.1 
 
 		 319 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  45.12 
 
 		 319 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  40.52 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  33.61 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  33.88 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  33.06 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  40.96 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  43.53 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.06 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  41.46 
 
 		 315 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.2 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  30.16 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.33 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  30.47 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  30.33 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  39.78 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 548 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  39.02 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  30.88 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  34.15 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  31.71 
 
 		 548 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  36.21 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  30.25 
 
 		 541 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  36.61 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  31.71 
 
 		 550 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  31.71 
 
 		 550 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  31.71 
 
 		 550 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  33.61 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  29.51 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  33.72 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  26.67 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  30.47 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  33.05 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  33.64 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  29.91 
 
 		 311 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  34.52 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  32.8 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  27.35 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  34.09 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  26.83 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  28.21 
 
 		 318 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  28.21 
 
 		 318 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  28.21 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  32.94 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  37.78 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  27.35 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.17 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  34.78 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  31.4 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  26.61 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  29.89 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  29.89 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  37.8 
 
 		 305 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  26.27 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  38.71 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  29.82 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  28.74 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  28.74 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  28.74 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  32.5 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  28.74 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  28.74 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  28.74 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  26.02 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  27.83 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  31.31 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  32 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  27.59 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  31.51 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  26.67 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  29.06 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  24.06 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  34.09 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  24.06 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  32.5 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  27.42 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  24.06 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  32.38 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  27.38 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  25.66 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  29.09 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  28.24 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  31.58 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  31.17 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  29.89 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  29.33 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  36.25 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.97 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  26.17 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  27.85 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  26.72 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  30.16 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  23.14 
 
 		 311 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  30.16 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>