82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0042 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  100 
 
 
270 aa  530  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  48.36 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  44.86 
 
 
249 aa  178  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  43.44 
 
 
255 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  43.85 
 
 
242 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  42.67 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  43.15 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4438  hypothetical protein  49.23 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.226653  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  42.68 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  42.68 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  42.68 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  40.33 
 
 
252 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  39.51 
 
 
250 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  42.97 
 
 
272 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  40.32 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  41.67 
 
 
262 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00170  hypothetical protein  40.66 
 
 
234 aa  148  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0524836  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  52.17 
 
 
296 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  43.89 
 
 
243 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  39.18 
 
 
309 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  35.63 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  40.65 
 
 
267 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  35.95 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0028  hypothetical protein  36.04 
 
 
251 aa  133  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  36.91 
 
 
266 aa  123  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  30.04 
 
 
245 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  31.61 
 
 
249 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  33.83 
 
 
244 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  23.61 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  26.81 
 
 
240 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  28.39 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  24.69 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  28.99 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  36.08 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  36.65 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  34 
 
 
306 aa  79  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  30.05 
 
 
236 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  32.26 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  26.01 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  24.03 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  31.43 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2386  hypothetical protein  31.55 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  26.53 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  36.04 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  30.98 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  23.93 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  32.61 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  31.17 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  26.53 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  27.59 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  35.61 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  31.31 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  23.47 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  29.67 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  31.63 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  40.38 
 
 
297 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  30.72 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  26.96 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  27.41 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  27.57 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  27.57 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  27.57 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  25.37 
 
 
234 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  28.45 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  24.38 
 
 
230 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  29.56 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  27.53 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  20.19 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  20.19 
 
 
243 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  25.98 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  22.57 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  21.48 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  28.28 
 
 
349 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  32.65 
 
 
300 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  32.22 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  31.67 
 
 
236 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  29.32 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  24.51 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  24.51 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  24.51 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  26.49 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0072  hypothetical protein  26.12 
 
 
2667 aa  42  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>