13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0040 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0040  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27010  hypothetical protein  56.86 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00310  hypothetical protein  50.98 
 
 
53 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.909556  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0074  hypothetical protein  47.06 
 
 
51 aa  52  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0061  hypothetical protein  49.02 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0016  hypothetical protein  45.1 
 
 
51 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0018  hypothetical protein  50 
 
 
52 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0284  hypothetical protein  52.5 
 
 
51 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389492  normal  0.0510522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0050  hypothetical protein  44.23 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0055  hypothetical protein  44.23 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0023  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03370  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0375  hypothetical protein  41.18 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>