More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0032 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  100 
 
 
214 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  43.81 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  38.12 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  37.24 
 
 
210 aa  92  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  38.31 
 
 
210 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  35.45 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30 
 
 
390 aa  85.1  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  36.49 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  28.64 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  37.35 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  40.17 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
241 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  31.55 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  37.06 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.56 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.86 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  36.87 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  36.62 
 
 
217 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  41.13 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  31.96 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  26.26 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  34 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  31.22 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  29.76 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  33.81 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  38.57 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  42.72 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  39.34 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.84 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.9 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  32.03 
 
 
263 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.43 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  38.05 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  40 
 
 
309 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  33.52 
 
 
304 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.43 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
268 aa  62.8  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  31.87 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
305 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
251 aa  62.8  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  35 
 
 
319 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
274 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.84 
 
 
251 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  32.39 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
239 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
261 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  27.92 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
225 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  43.93 
 
 
271 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.41 
 
 
204 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  34.96 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 
382 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  32.39 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  38.1 
 
 
304 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  34.96 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  37.59 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  35.4 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1437  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00131296  decreased coverage  0.0000500722 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
247 aa  60.1  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  34.15 
 
 
249 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  34.15 
 
 
249 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  41.58 
 
 
252 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  29.76 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  34.15 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  34.15 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  34.15 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
272 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  34.09 
 
 
237 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  40.95 
 
 
282 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  40.19 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.16 
 
 
243 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  38.21 
 
 
279 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  28.57 
 
 
400 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  34.92 
 
 
257 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
201 aa  58.2  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>