108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0031 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  100 
 
 
276 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  38.37 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  39.52 
 
 
282 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 
330 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  30.46 
 
 
254 aa  82  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  32.95 
 
 
237 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  25.62 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  24.64 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  32.26 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  24.64 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  24.64 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  29.81 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  24.64 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  24.64 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  23.7 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  24.64 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  24.15 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  23.22 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  25.58 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  26.43 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  23.22 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  24.15 
 
 
217 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  26.84 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  28 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  28.95 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 
335 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  30.86 
 
 
248 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  27.39 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  27.74 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  27.83 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  25.82 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  26.36 
 
 
217 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  26.82 
 
 
217 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  26.36 
 
 
217 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.51 
 
 
307 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
220 aa  55.8  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  26.8 
 
 
349 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  24.02 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  23.65 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 
232 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 
230 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  27.12 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  27.74 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 
348 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  29.09 
 
 
276 aa  52.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 
241 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 
349 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  23.53 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  23.53 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  23.53 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  29.51 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  29.51 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  29.51 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 
354 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
221 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  23.81 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.18 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  23.31 
 
 
228 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  24.44 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  27.34 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  23.64 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 
268 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  25.83 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  28.12 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  22.62 
 
 
240 aa  46.2  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  22.87 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  23.28 
 
 
221 aa  45.8  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  27.75 
 
 
255 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  25.21 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  22.83 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  23.56 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  22.91 
 
 
179 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
172 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  24.44 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  25 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  21.6 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  24.35 
 
 
566 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  26.34 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>