More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5018 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 377 aa  771    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  30.72 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 535 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  33 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.34 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  25.34 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  26.26 
 
 		 723 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 904 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.55 
 
 		 394 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 402 aa  93.2  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 414 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  30.37 
 
 		 564 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  27.73 
 
 		 569 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 409 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  26.35 
 
 		 557 aa  86.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0995  CheY protein  32.37 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 1177 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25.25 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  27.44 
 
 		 1188 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  26.24 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 1177 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  21.7 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  25.94 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  21.29 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  29.49 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  23.89 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3354  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.9 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.84 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  23.96 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  22.92 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  23.29 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.02 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  23.39 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 368 aa  67  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  22.48 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>