More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4974 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  75.2 
 
 		 128 aa  196  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  73.6 
 
 		 128 aa  191  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  68.5 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  71.77 
 
 		 127 aa  183  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  70.97 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  70.97 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  70.97 
 
 		 127 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  70.97 
 
 		 127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  70.16 
 
 		 127 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  70.16 
 
 		 127 aa  180  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  70.16 
 
 		 127 aa  180  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  68.55 
 
 		 127 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  69.35 
 
 		 127 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  69.35 
 
 		 127 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  69.35 
 
 		 127 aa  177  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  69.35 
 
 		 127 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  69.35 
 
 		 127 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  68.55 
 
 		 127 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  67.77 
 
 		 127 aa  173  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  66.94 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  62.9 
 
 		 128 aa  167  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  62.9 
 
 		 128 aa  167  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  60.48 
 
 		 127 aa  163  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  61.48 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  61.29 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  61.29 
 
 		 126 aa  157  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  60.48 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  59.02 
 
 		 126 aa  156  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  59.02 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  56.8 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  61.6 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  56.56 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  56.2 
 
 		 128 aa  143  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  55.83 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  55.37 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  52.8 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  58.4 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  53.91 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 127 aa  136  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  52.42 
 
 		 128 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  53.28 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  48 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  47.93 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  44.72 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  50.82 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  49.57 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  49.57 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  45.76 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  44.8 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>