237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4908 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  100 
 
 
240 aa  495  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  56.12 
 
 
238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  55.7 
 
 
238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  55.7 
 
 
238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  55.7 
 
 
238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  52.72 
 
 
240 aa  270  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  55.27 
 
 
246 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  51.05 
 
 
239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  51.05 
 
 
239 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  50.63 
 
 
239 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  50.63 
 
 
239 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  50.63 
 
 
239 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  51.29 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  50 
 
 
239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  43.53 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  39.22 
 
 
228 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  38.79 
 
 
228 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  35.18 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 
233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  37.96 
 
 
235 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  31.65 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  33.62 
 
 
231 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  37.96 
 
 
233 aa  121  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  36.87 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  32.51 
 
 
234 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  33.05 
 
 
229 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  32.78 
 
 
244 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  31.31 
 
 
229 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  34.9 
 
 
243 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  33.68 
 
 
224 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  34.9 
 
 
243 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  33.83 
 
 
237 aa  98.6  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  34.03 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
288 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  31.47 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  32.95 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  34.04 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  31.71 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  29.7 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  29.7 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  28.09 
 
 
237 aa  88.2  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  30.21 
 
 
245 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  25.97 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  35.35 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  37.68 
 
 
241 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  30.33 
 
 
251 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  28.27 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  31.75 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  30.05 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  32.3 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  34.73 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  35.19 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.15 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  35.19 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  29.86 
 
 
238 aa  85.9  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  30.92 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  31.87 
 
 
237 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  35 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  31.03 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  28.42 
 
 
232 aa  85.5  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  32.3 
 
 
236 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.6 
 
 
222 aa  85.1  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  27.06 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  34.38 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  34.38 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.73 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  32.79 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  28.51 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  35.14 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  33.91 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  34.16 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  34.66 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  28.42 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  25.73 
 
 
244 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  26.81 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  28.08 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  33.75 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  25.68 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  33.51 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  26.42 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  32.97 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  30.36 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  38.19 
 
 
237 aa  79  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  25.42 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  29.09 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  32.35 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  31.49 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  32.75 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  26.29 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  27.64 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  26.63 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  33.57 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  29.73 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>