More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4837 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 		 325 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.98 
 
 		 316 aa  292  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  50.34 
 
 		 312 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  51.18 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  51.52 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  43.59 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.11 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  41.96 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  43.59 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  36.39 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  40.2 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  41.76 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.74 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  40.14 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  41.26 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  40.91 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.38 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.26 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  39.35 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  38.72 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  38.72 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  37.41 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.46 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.16 
 
 		 309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  43.21 
 
 		 456 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  37.09 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  35.6 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  35.6 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  37.91 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  41.15 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  37.25 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  43.4 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.61 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  41.5 
 
 		 401 aa  205  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  43.04 
 
 		 402 aa  205  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  37.25 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  42.13 
 
 		 406 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  42.13 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.45 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  34.35 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.58 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.58 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  39.64 
 
 		 367 aa  203  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  34.01 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  34.01 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.35 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  34.01 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  34.01 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  42.04 
 
 		 369 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  43.16 
 
 		 406 aa  202  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.67 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  42.62 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  35.92 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  38.08 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.36 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  40.91 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.75 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  41.98 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  33.22 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  40.82 
 
 		 369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  41.45 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  36.49 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  36.49 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  36.49 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.49 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.49 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  43.36 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  36.49 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  39.78 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  36.49 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  33 
 
 		 312 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  37.75 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  37.75 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.86 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.86 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  37.75 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  37.75 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  39.3 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  36.49 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.7 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  39.86 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  39.86 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.14 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  45.85 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  43.51 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.86 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  41.76 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  41.94 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  36.73 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  36.07 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  36.73 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  43.4 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.35 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.6 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.6 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  35.6 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.6 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.6 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  37.59 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.6 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>