More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4833 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
418 aa  855    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.52 
 
 
416 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.31 
 
 
418 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.17 
 
 
418 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.31 
 
 
418 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.93 
 
 
418 aa  478  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.07 
 
 
418 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.53 
 
 
418 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.48 
 
 
418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.59 
 
 
423 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.78 
 
 
418 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.49 
 
 
414 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.1 
 
 
413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.35 
 
 
418 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.18 
 
 
420 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.64 
 
 
415 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.4 
 
 
415 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.62 
 
 
415 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.4 
 
 
415 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.16 
 
 
415 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.43 
 
 
415 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.71 
 
 
418 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.66 
 
 
435 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.43 
 
 
415 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.18 
 
 
415 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.43 
 
 
415 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.42 
 
 
425 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.59 
 
 
415 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.78 
 
 
418 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.54 
 
 
416 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 
434 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.42 
 
 
421 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
418 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
430 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.53 
 
 
448 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 
420 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.17 
 
 
418 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.19 
 
 
428 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.41 
 
 
456 aa  411  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.34 
 
 
415 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 
411 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.62 
 
 
427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.02 
 
 
418 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 
419 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.99 
 
 
423 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.57 
 
 
415 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.15 
 
 
423 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.75 
 
 
435 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.49 
 
 
424 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.34 
 
 
435 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 
415 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.75 
 
 
423 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.32 
 
 
425 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.34 
 
 
429 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 
423 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 
423 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.65 
 
 
425 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 
435 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.78 
 
 
424 aa  391  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.18 
 
 
417 aa  388  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.37 
 
 
446 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.12 
 
 
421 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 
421 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.3 
 
 
425 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.83 
 
 
419 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 
421 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.12 
 
 
426 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.87 
 
 
421 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.12 
 
 
426 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.78 
 
 
421 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.26 
 
 
423 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.12 
 
 
426 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.51 
 
 
421 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.97 
 
 
419 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.76 
 
 
416 aa  384  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.14 
 
 
414 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.99 
 
 
423 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.23 
 
 
423 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.45 
 
 
432 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.5 
 
 
423 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.72 
 
 
423 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 
419 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.39 
 
 
418 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.48 
 
 
423 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.79 
 
 
423 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.39 
 
 
418 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.47 
 
 
417 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.94 
 
 
418 aa  381  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.5 
 
 
423 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.32 
 
 
426 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.5 
 
 
458 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.5 
 
 
458 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.31 
 
 
419 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.37 
 
 
426 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.5 
 
 
458 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.08 
 
 
419 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.5 
 
 
458 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.23 
 
 
423 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>